RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CCNC-208	ENST00000519617	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	XP32	Q5T750	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	PHKA2	P46019	1235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	APBB1	O00213	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	C2CD2L	O14523	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	COL8A1	P27658	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	MSX1	P28360	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	BAG6	P46379	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	USP4	Q13107	963 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	RUBCNL	Q9H714	662 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	BNIP3L	O60238	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	BMP4	P12644	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	CTBS	Q01459	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	PIK3R2	O00459	728 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	ARAF	P10398	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	FGFR3	P22607	806 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	GNB5	O14775	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	EPX	P11678	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNC-208	ENST00000519617	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	FURIN	P09958	794 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	AMPD1	P23109	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	DGKG	P49619	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	TLR1	Q15399	786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	INHA	P05111	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	ATP4A	P20648	1035 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	SCNN1D	P51172	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	IRF5	Q13568	498 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNC-208	ENST00000519617	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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