RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.79■■□□□ 1.88
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CLDN23-201ENST00000519106 MSH5O43196 834 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN23-201ENST00000519106 KCNQ3O43525 872 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN23-201ENST00000519106 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN23-201ENST00000519106 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN23-201ENST00000519106 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.77■■□□□ 1.88
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CLDN23-201ENST00000519106 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.75■■□□□ 1.87
CLDN23-201ENST00000519106 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.75■■□□□ 1.87
CLDN23-201ENST00000519106 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.75■■□□□ 1.87
CLDN23-201ENST00000519106 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.75■■□□□ 1.87
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CLDN23-201ENST00000519106 PDE3AQ14432 1141 aa26.74■■□□□ 1.87
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CLDN23-201ENST00000519106 KIF16BQ96L93 1317 aa26.73■■□□□ 1.87
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CLDN23-201ENST00000519106 USP21Q9UK80 565 aa26.7■■□□□ 1.87
CLDN23-201ENST00000519106 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.7■■□□□ 1.86
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CLDN23-201ENST00000519106 COG6Q9Y2V7 657 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN23-201ENST00000519106 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN23-201ENST00000519106 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CLDN23-201ENST00000519106 ZNF790Q6PG37 636 aa26.68■■□□□ 1.86
CLDN23-201ENST00000519106 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CLDN23-201ENST00000519106 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.67■■□□□ 1.86
CLDN23-201ENST00000519106 SLC4A2P04920 1241 aa26.66■■□□□ 1.86
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CLDN23-201ENST00000519106 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.65■■□□□ 1.86
CLDN23-201ENST00000519106 MS4A1P11836 297 aa26.64■■□□□ 1.86
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CLDN23-201ENST00000519106 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.63■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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CLDN23-201ENST00000519106 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.61■■□□□ 1.85
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CLDN23-201ENST00000519106 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.6■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.59■■□□□ 1.85
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CLDN23-201ENST00000519106 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 G2E3Q7L622 706 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN23-201ENST00000519106 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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CLDN23-201ENST00000519106 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN23-201ENST00000519106 PTPRCP08575 1304 aa26.55■■□□□ 1.84
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CLDN23-201ENST00000519106 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 ANXA1P04083 346 aa26.51■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.51■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 RGS12O14924 1447 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN23-201ENST00000519106 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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