RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC18Q5T9S5 1454 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMN2Q9NZ56 1722 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ROBO2Q9HCK4 1378 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 NBPF1Q3BBV0 1214 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIM2Q9P1W9 311 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CST9Q5W186 159 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNE4Q8N205 404 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 STAP2Q9UGK3 403 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEAK1Q9H792 1746 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 EYSQ5T1H1 3165 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACEP12821 1306 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL24A1Q17RW2 1714 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBD5Q9P267 1494 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCB7O75027 752 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABBR2O75899 941 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNA3P22001 575 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FLAD1Q8NFF5 587 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM106CQ9BVX2 250 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 NALCNQ8IZF0 1738 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC21AQ8NDW8 1320 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAF5O00463 557 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 MMP10P09238 476 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCAMP50895 628 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST3GAL2Q16842 350 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERFEQ4G0M1 354 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL27Q8NEV9 243 aa3.24□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PHF8Q9UPP1 1060 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERBB3P21860 1342 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM22K7EJ46 135 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHF14O94880 888 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPHX2P34913 555 aa3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PHOX2BQ99453 314 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf16Q9NQ32 467 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEB2H3BUK9 544 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOC5O00471 708 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR37L1O60883 481 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HACL1Q9UJ83 578 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC141Q6ZP82 1450 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKD1L3Q7Z443 1732 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 REV3LO60673 3130 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa3.21□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHD6Q8TD26 2715 aa3.21□□□□□ -1.89
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAIPQ13075 1403 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOSL2P15408 326 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 ID4P47928 161 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF697Q5TEC3 545 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAMD7Q7Z3H4 446 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP38Q8NB14 1042 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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