RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.92■■□□□ 1.58
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ITGA3-215ENST00000515147 GNPATO15228 680 aa24.92■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.92■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 PHKG2P15735 406 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 KDRP35968 1356 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 KIF3CO14782 793 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 ATG3Q9NT62 314 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 ATP6V1AP38606 617 aa24.89■■□□□ 1.58
ITGA3-215ENST00000515147 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.89■■□□□ 1.58
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ITGA3-215ENST00000515147 MMP10P09238 476 aa24.88■■□□□ 1.57
ITGA3-215ENST00000515147 C4AP0C0L4 1744 aa24.87■■□□□ 1.57
ITGA3-215ENST00000515147 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
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ITGA3-215ENST00000515147 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.87■■□□□ 1.57
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ITGA3-215ENST00000515147 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
ITGA3-215ENST00000515147 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.82■■□□□ 1.56
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ITGA3-215ENST00000515147 PANK3Q9H999 370 aa24.8■■□□□ 1.56
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ITGA3-215ENST00000515147 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.74■■□□□ 1.55
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ITGA3-215ENST00000515147 CABP4P57796 275 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGA3-215ENST00000515147 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.68■■□□□ 1.54
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ITGA3-215ENST00000515147 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.65■■□□□ 1.54
ITGA3-215ENST00000515147 MTHFSP49914 203 aa24.64■■□□□ 1.54
ITGA3-215ENST00000515147 FKBP8Q14318 412 aa24.64■■□□□ 1.54
ITGA3-215ENST00000515147 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
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ITGA3-215ENST00000515147 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ITGA3-215ENST00000515147 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.63■■□□□ 1.53
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ITGA3-215ENST00000515147 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.62■■□□□ 1.53
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ITGA3-215ENST00000515147 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.58■■□□□ 1.53
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ITGA3-215ENST00000515147 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ITGA3-215ENST00000515147 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ITGA3-215ENST00000515147 TM4SF1P30408 202 aa24.57■■□□□ 1.52
ITGA3-215ENST00000515147 RNF181Q9P0P0 153 aa24.56■■□□□ 1.52
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ITGA3-215ENST00000515147 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGA3-215ENST00000515147 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.53■■□□□ 1.52
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