RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.33□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 GOLGA3Q08378 1498 aa7.33□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 CCER2I3L3R5 266 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 MAPK8P45983 427 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 PLCB3Q01970 1234 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 TBX22Q9Y458 520 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 CLIP1P30622 1438 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 FOXO3O43524 673 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 RBL2Q08999 1139 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 USP4Q13107 963 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 PRR14Q9BWN1 585 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 ANP32CO43423 234 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 IGFBP4P22692 258 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 TNNI2P48788 182 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 RNF20Q5VTR2 975 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 SDE2Q6IQ49 451 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 WIZO95785 1651 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 PSMD2Q13200 908 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 PIF1Q9H611 641 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 TMC1Q8TDI8 760 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 FAM129BQ96TA1 746 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 EEA1Q15075 1411 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 FZD6O60353 706 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 MSS51Q4VC12 460 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 GPR182O15218 404 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 NACADO15069 1562 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 ESPNB1AK53 854 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 MARCH6O60337 910 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 POTEIP0CG38 1075 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 GPATCH3Q96I76 525 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF358Q9NW07 568 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 MMP16P51512 607 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 ATP2B2Q01814 1243 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 SETDB2Q96T68 719 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC24D-211ENST00000511481 SPACA7Q96KW9 195 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ARID5AQ03989 594 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 PDE3BQ13370 1112 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 SOGA3Q5TF21 947 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 C16orf46Q6P387 395 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ARHGAP33O14559 1287 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 RAB11FIP3O75154 756 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 NR1I2O75469 434 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 POTEHQ6S545 545 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ERFEQ4G0M1 354 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 NBPF3Q9H094 633 aa7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 LRCH3Q96II8 777 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 WDR97A6NE52 1622 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC24D-211ENST00000511481 GNA15P30679 374 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.4 ms