RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		15.68	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		15.67	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		15.66	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	STK32B	Q9NY57	414 aa		15.66	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		15.66	■□□□□ 0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PDIA6	Q15084	440 aa		15.64	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		15.63	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		15.63	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		15.63	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CABP1	Q9NZU7	370 aa		15.62	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PBX2	P40425	430 aa		15.61	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNRD1	Q16881	649 aa		15.61	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		15.61	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		15.61	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC5	O00471	708 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	FOSB	P53539	338 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC37A3	O60309	1634 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	USP6	P35125	1406 aa		15.6	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGER2	P43116	358 aa		15.59	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC15A2	Q16348	729 aa		15.59	■□□□□ 0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		15.58	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT17	Q9BSW7	474 aa		15.58	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MTFR1L	Q9H019	292 aa		15.58	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		15.58	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PEAK1	Q9H792	1746 aa		15.57	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		15.57	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		15.57	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF14	O94880	888 aa		15.56	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CASZ1	Q86V15	1759 aa		15.55	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOM1	P52179	1685 aa		15.55	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SLIT3	O75094	1523 aa		15.55	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL9	O00512	1426 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	EVC2	Q86UK5	1308 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW7	Q969H0	707 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ARX	Q96QS3	562 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	EPAS1	Q99814	870 aa		15.54	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC7	Q96M83	1385 aa		15.53	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR162	Q16538	588 aa		15.53	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		15.52	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		15.52	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP33	O14559	1287 aa		15.52	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF8	P60827	252 aa		15.52	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		15.52	■□□□□ 0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SBF2	Q86WG5	1849 aa		15.52	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		15.51	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		15.51	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		15.51	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		15.51	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		15.5	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TNS2	Q63HR2	1409 aa		15.5	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP12	Q02952	1782 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3C2A	O00443	1686 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX12P	Q92771	950 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	UTRN	P46939	3433 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IL2RB	P14784	551 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	POLD1	P28340	1107 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	COL18A1	P39060	1754 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRE	P23469	700 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	15.46	■□□□□ 0.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF827	Q17R98	1081 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K5	Q99683	1374 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	15.43	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NBR1	Q14596	966 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK17	Q96T54	332 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NHS	Q6T4R5	1651 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TMC1	Q8TDI8	760 aa		15.41	■□□□□ 0.06

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