RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	EXOC4	Q96A65	974 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	GBP3	Q9H0R5	595 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPS18	Q9P253	973 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELP1	O95163	1332 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF11	Q86T75	865 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	BICD2	Q8TD16	824 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF4	Q96M43	638 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	STK31	Q9BXU1	1019 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	CENPH	Q9H3R5	247 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYO6	Q9UM54	1294 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERCC3	P19447	782 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM212A	Q96EL1	285 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	GSDMD	P57764	484 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	VEZT	Q9HBM0	779 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP160	Q12769	1436 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	USP48	Q86UV5	1035 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	POTED	Q86YR6	584 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR63	Q8IWG1	891 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEP89	Q96ST8	783 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC27	Q2M243	656 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLK	Q9UBT6	870 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	APBB1	O00213	710 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	EBAG9	O00559	213 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR29	P0C7W0	189 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	DDIT3	P35638	169 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEDD9	Q14511	834 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAVIN2	O95810	425 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ST7	Q9NRC1	585 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	POTEB2	H3BUK9	544 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	RUNDC1	Q96C34	613 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERC2	O15083	957 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		9.58	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLCN6	P51797	869 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUCB1	Q02818	461 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	MCM6	Q14566	821 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMARCE1	Q969G3	411 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	TTC36	A6NLP5	189 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	MORC1	Q86VD1	984 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIRT1	Q96EB6	747 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		9.57	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCK	P35557	465 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRT85	P78386	507 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF3	Q9H094	633 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF165	P49910	485 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPRG	P23470	1445 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAA25	Q14CX7	972 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	RUFY1	Q96T51	708 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	NLRP1	Q9C000	1473 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	9.56	□□□□□ -0.88
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	9.56	□□□□□ -0.88

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