RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	PHKG2	P15735	406 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	GNPAT	O15228	680 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP6V1A	P38606	617 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	HSPA6	P17066	643 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	KDR	P35968	1356 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SIMC1-208	ENST00000495423	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SIMC1-208	ENST00000495423	MMP10	P09238	476 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SIMC1-208	ENST00000495423	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SIMC1-208	ENST00000495423	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SIMC1-208	ENST00000495423	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF3C	O14782	793 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	TGFB2	P61812	414 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	ADRA2B	P18089	450 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SIMC1-208	ENST00000495423	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	DCAF5	Q96JK2	942 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	GYS1	P13807	737 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	BCS1L	Q9Y276	419 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A0G2JLW4	131 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	TJP1	Q07157	1748 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SIMC1-208	ENST00000495423	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	RFC4	P35249	363 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	DPEP1	P16444	411 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	TOMM70	O94826	608 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	CABP4	P57796	275 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	SBF1	O95248	1867 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	APLP1	P51693	650 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SIMC1-208	ENST00000495423	FCHSD2	O94868	740 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	KCNA3	P22001	575 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	WDR90	Q96KV7	1748 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	MTHFS	P49914	203 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	PANK3	Q9H999	370 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SIMC1-208	ENST00000495423	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	PIM2	Q9P1W9	311 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	FKBP8	Q14318	412 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	DDR1	Q08345	913 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SIMC1-208	ENST00000495423	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.56	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	MRC1	P22897	1456 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	TM4SF1	P30408	202 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	IL13	P35225	146 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.51	■■■□□ 2.64
SIMC1-208	ENST00000495423	CHRNA5	P30532	468 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	FSTL1	Q12841	308 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms