RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	CAGE1	Q8TC20	777 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	KRT32	Q14532	448 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	KIF18A	Q8NI77	898 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002		F6X3S4	739 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	DDX11	Q96FC9	970 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	TMX3	Q96JJ7	454 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	SMARCE1	Q969G3	411 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	A2M	P01023	1474 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
MEGF6-205	ENST00000485002	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		18.52	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002		H0YHG0	523 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	STX6	O43752	255 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	HS1BP3	Q53T59	392 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	NME9	Q86XW9	330 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	18.51	■□□□□ 0.55	2e-6	■■■□□ 15.4
MEGF6-205	ENST00000485002	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	SDS	P20132	328 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	RAB11FIP3	O75154	756 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	XBP1	P17861	261 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ATF3	P18847	181 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	UBE2H	P62256	183 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	18.5	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	NSD2	O96028	1365 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ERLIN1	O75477	346 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ABCC2	Q92887	1545 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	CEP170	Q5SW79	1584 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	EVA1C	P58658	441 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	ANO10	Q9NW15	660 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	SMTNL1	A8MU46	457 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	VPS53	Q5VIR6	699 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	MBIP	Q9NS73	344 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	CDR1	P51861	262 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	PTPRC	P08575	1304 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	DACH1	Q9UI36	760 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MEGF6-205	ENST00000485002	PIK3C2G	O75747	1445 aa		18.46	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	GJB2	P29033	226 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF165	P49910	485 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	SPG7	Q9UQ90	795 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	NEMF	O60524	1076 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	USP48	Q86UV5	1035 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	CTAGE5	O15320	804 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MEGF6-205	ENST00000485002	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54

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