RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.13■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.12■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 PCNTO95613 3336 aa22.12■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 RRAGCQ9HB90 399 aa22.11■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 ATP6V1AP38606 617 aa22.1■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.1■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.1■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 TMF1P82094 1093 aa22.09■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 ITPK1Q13572 414 aa22.09■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 RNF181Q9P0P0 153 aa22.09■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.08■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.08■■□□□ 1.13
SRPRB-204ENST00000484684 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.08■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.07■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.07■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.06■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 INSRP06213 1382 aa22.06■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 PIM2Q9P1W9 311 aa22.05■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.04■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 SPG7Q9UQ90 795 aa22.04■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 C4AP0C0L4 1744 aa22.03■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 FLT4P35916 1363 aa22.03■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.02■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 KCNA3P22001 575 aa22.02■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 DCAF5Q96JK2 942 aa22.02■■□□□ 1.12
SRPRB-204ENST00000484684 RFC4P35249 363 aa22.01■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 GYS1P13807 737 aa22■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 ADRA2BP18089 450 aa22■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 FYB1O15117 783 aa21.99■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 ATG3Q9NT62 314 aa21.98■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.97■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 TONSLQ96HA7 1378 aa21.96■■□□□ 1.11
SRPRB-204ENST00000484684 SLC34A2O95436 690 aa21.95■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 KDRP35968 1356 aa21.95■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.94■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 RPS6KA4O75676 772 aa21.93■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 PHKG2P15735 406 aa21.93■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.93■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 CHRNA5P30532 468 aa21.92■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 RASSF7Q02833 373 aa21.91■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.91■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 TESK2Q96S53 571 aa21.91■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.91■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 NCAPD2Q15021 1401 aa21.9■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 SBF1O95248 1867 aa21.9■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 GLTPD2A6NH11 291 aa21.9■■□□□ 1.1
SRPRB-204ENST00000484684 SLC24A1O60721 1099 aa21.89■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.88■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 LMNB1P20700 586 aa21.88■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 DDR1Q08345 913 aa21.87■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 FKBP8Q14318 412 aa21.87■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.87■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.86■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 EYA1Q99502 592 aa21.85■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.84■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.83■■□□□ 1.09
SRPRB-204ENST00000484684 FOXN1O15353 648 aa21.82■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 CREBZFQ9NS37 354 aa21.82■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.81■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.8■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.8■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.8■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 CABP4P57796 275 aa21.79■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 AIDAQ96BJ3 306 aa21.79■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 POTECB2RU33 542 aa21.77■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 ZPR1O75312 459 aa21.77■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 TM4SF1P30408 202 aa21.77■■□□□ 1.08
SRPRB-204ENST00000484684 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 CHADLQ6NUI6 762 aa21.76■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 TTLL6Q8N841 843 aa21.76■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 FAM161AQ3B820 660 aa21.75■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.75■■□□□ 1.07
SRPRB-204ENST00000484684 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms