RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.64■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.62■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 KCNA3P22001 575 aa20.62■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.62■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 ATP6V1AP38606 617 aa20.61■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 TMF1P82094 1093 aa20.61■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.59■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.59■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 PCNTO95613 3336 aa20.58■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.58■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.58■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 DCAF5Q96JK2 942 aa20.58■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 PIM2Q9P1W9 311 aa20.58■□□□□ 0.89
SOGA3-206ENST00000474293 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.57■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.55■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.55■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 GYS1P13807 737 aa20.54■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.54■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 RTL1A6NKG5 1358 aa20.54■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 ITGB4P16144 1822 aa20.53■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 CHRNA5P30532 468 aa20.53■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 RASSF7Q02833 373 aa20.52■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SOGA3-206ENST00000474293 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 FOXN1O15353 648 aa20.51■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 RFC4P35249 363 aa20.51■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 ATG3Q9NT62 314 aa20.51■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 C4AP0C0L4 1744 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 FAM161AQ3B820 660 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 GLTPD2A6NH11 291 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 NEUROD1Q13562 356 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 SPG7Q9UQ90 795 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 INSRP06213 1382 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-206ENST00000474293 FYB1O15117 783 aa20.44■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 DDR1Q08345 913 aa20.44■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.44■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 RPS6KA4O75676 772 aa20.43■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 FKBP8Q14318 412 aa20.43■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 POTECB2RU33 542 aa20.42■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 LMNB1P20700 586 aa20.42■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.42■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 KDRP35968 1356 aa20.42■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 CREBZFQ9NS37 354 aa20.41■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 FLT4P35916 1363 aa20.41■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 PHKG2P15735 406 aa20.4■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.4■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 SBF1O95248 1867 aa20.39■□□□□ 0.86
SOGA3-206ENST00000474293 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.39■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 AIDAQ96BJ3 306 aa20.39■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 LBX1P52954 281 aa20.38■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 ABHD8Q96I13 439 aa20.38■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.38■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 POTEIP0CG38 1075 aa20.36■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 POTEJP0CG39 1038 aa20.36■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 CNTNAP1P78357 1384 aa20.35■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 CHADLQ6NUI6 762 aa20.35■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.34■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 EYA1Q99502 592 aa20.34■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SOGA3-206ENST00000474293 NFKBIEO00221 500 aa20.32■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 TM4SF1P30408 202 aa20.32■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 VEGFBP49765 207 aa20.32■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 NCAPD2Q15021 1401 aa20.32■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.32■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 TESK2Q96S53 571 aa20.31■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.3■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 TTLL6Q8N841 843 aa20.3■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 TONSLQ96HA7 1378 aa20.3■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 WBP1LQ9NX94 342 aa20.29■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-206ENST00000474293 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.1 ms