RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
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USP20-204ENST00000472108 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 CERKQ8TCT0 537 aa20.85■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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USP20-204ENST00000472108 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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USP20-204ENST00000472108 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.84■□□□□ 0.93
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USP20-204ENST00000472108 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
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USP20-204ENST00000472108 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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USP20-204ENST00000472108 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.7■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 EXOC5O00471 708 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
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USP20-204ENST00000472108 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.68■□□□□ 0.9
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USP20-204ENST00000472108 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.67■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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USP20-204ENST00000472108 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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USP20-204ENST00000472108 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.64■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 BARGINQ6ZT62 677 aa20.64■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 C8orf37Q96NL8 207 aa20.64■□□□□ 0.9
USP20-204ENST00000472108 HSPA1LP34931 641 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 HYPKQ9NX55 129 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 TNS2Q63HR2 1409 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 ANXA1P04083 346 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 PDIA6Q15084 440 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 VPS72Q15906 364 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 DDB1Q16531 1140 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 USP16Q9Y5T5 823 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-204ENST00000472108 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.61■□□□□ 0.89
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