RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.32■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 DCAF5Q96JK2 942 aa26.32■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.31■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 CHD4Q14839 1912 aa26.31■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.3■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.3■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 CABP4P57796 275 aa26.28■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.28■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 MTHFSP49914 203 aa26.27■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.27■■□□□ 1.8
SHQ1-206ENST00000471526 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.26■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.25■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 C1QTNF8P60827 252 aa26.24■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.24■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 IL13P35225 146 aa26.23■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.23■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 KDRP35968 1356 aa26.22■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.22■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.21■■□□□ 1.79
SHQ1-206ENST00000471526 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 MMP10P09238 476 aa26.2■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.18■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 RPS6KA4O75676 772 aa26.17■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.17■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.16■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 RFC4P35249 363 aa26.16■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 ADRA2BP18089 450 aa26.15■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 HMOX1P09601 288 aa26.14■■□□□ 1.78
SHQ1-206ENST00000471526 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.13■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 GYS1P13807 737 aa26.12■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 LGR6Q9HBX8 967 aa26.11■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 ATP10DQ9P241 1426 aa26.1■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 A0A0G2JLW4 131 aa26.08■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.08■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.08■■□□□ 1.77
SHQ1-206ENST00000471526 TGFB2P61812 414 aa26.07■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.07■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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SHQ1-206ENST00000471526 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.06■■□□□ 1.76
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SHQ1-206ENST00000471526 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
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SHQ1-206ENST00000471526 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.04■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.04■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 DPEP1P16444 411 aa26.02■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 FKBP8Q14318 412 aa26.02■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SHQ1-206ENST00000471526 ADCY9O60503 1353 aa26.01■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.01■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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SHQ1-206ENST00000471526 FCHSD2O94868 740 aa25.98■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.98■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 ZPR1O75312 459 aa25.97■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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SHQ1-206ENST00000471526 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.96■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.96■■□□□ 1.75
SHQ1-206ENST00000471526 C4AP0C0L4 1744 aa25.95■■□□□ 1.74
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SHQ1-206ENST00000471526 TJP1Q07157 1748 aa25.94■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 KCNA3P22001 575 aa25.94■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 TM4SF1P30408 202 aa25.93■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 PIM2Q9P1W9 311 aa25.93■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 MRC1P22897 1456 aa25.92■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.92■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.92■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.91■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 TEFQ10587 303 aa25.9■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.9■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.9■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.89■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.89■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 CHRNA5P30532 468 aa25.89■■□□□ 1.74
SHQ1-206ENST00000471526 IL17REQ8NFR9 667 aa25.89■■□□□ 1.74
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