RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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RABGGTB-206ENST00000467748 GTF2IP78347 998 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 NOD1Q9Y239 953 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 INHAP05111 366 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ITGA6P23229 1130 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TLR1Q15399 786 aa8.68□□□□□ -1.02
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RABGGTB-206ENST00000467748 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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RABGGTB-206ENST00000467748 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 VSIG8P0DPA2 414 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PSME1Q06323 249 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
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RABGGTB-206ENST00000467748 CLDN10P78369 228 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.66□□□□□ -1.02
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RABGGTB-206ENST00000467748 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 USP3Q9Y6I4 520 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 C4orf17Q53FE4 359 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ZMYND15Q9H091 742 aa8.65□□□□□ -1.02
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RABGGTB-206ENST00000467748 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT76Q01546 638 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 GPAMQ9HCL2 828 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF358Q9NW07 568 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-206ENST00000467748 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-206ENST00000467748 OGFOD1Q8N543 542 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC102BQ68D86 513 aa8.61□□□□□ -1.03
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RABGGTB-206ENST00000467748 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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RABGGTB-206ENST00000467748 TNS4Q8IZW8 715 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 ARID3CA6NKF2 412 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 SFI1A8K8P3 1242 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 THBS1P07996 1170 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 RASA1P20936 1047 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 RFX1P22670 979 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-206ENST00000467748 MTFR1Q15390 333 aa8.59□□□□□ -1.03
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RABGGTB-206ENST00000467748 ATP1A2P50993 1020 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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RABGGTB-206ENST00000467748 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 EPHA4P54764 986 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 CABP1Q9NZU7 370 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1B0GTH6 734 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK2AP1O14519 115 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 BACH1O14867 736 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 GAS6Q14393 721 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.56□□□□□ -1.04
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