RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	TSPYL6	Q8N831	410 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	CRBN	Q96SW2	442 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	CYP27B1	O15528	508 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	PHKG2	P15735	406 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	TNN	Q9UQP3	1299 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	TNS2	Q63HR2	1409 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	15.65	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		15.65	■□□□□ 0.1
TCL6-204	ENST00000460130	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		15.64	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	LGR6	Q9HBX8	967 aa		15.64	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	PDE3A	Q14432	1141 aa		15.63	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	KRT24	Q2M2I5	525 aa		15.63	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF428	Q96B54	188 aa		15.63	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		15.63	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		15.62	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		15.62	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		15.62	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	RLBP1	P12271	317 aa		15.61	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	ITGB4	P16144	1822 aa		15.61	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	DCAF5	Q96JK2	942 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	CACNA1F	O60840	1977 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	FAM182B	Q5T319	152 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	PANK1	Q8TE04	598 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	RGS12	O14924	1447 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	MRC1	P22897	1456 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TCL6-204	ENST00000460130	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	SBF2	Q86WG5	1849 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	CABP4	P57796	275 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	TEF	Q10587	303 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	TRIM27	P14373	513 aa		15.56	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		15.56	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		15.55	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		15.55	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	KCNQ3	O43525	872 aa		15.55	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		15.55	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		15.55	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		15.55	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	KIF16B	Q96L93	1317 aa		15.54	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	COG6	Q9Y2V7	657 aa		15.54	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		15.53	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		15.53	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	BTBD11	A6QL63	1104 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TCL6-204	ENST00000460130	PAPPA	Q13219	1627 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	KCNQ2	O43526	872 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	PIGB	Q92521	554 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	C5	P01031	1676 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	ABCC4	O15439	1325 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	SLC39A6	Q13433	755 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	NHS	Q6T4R5	1651 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	BCL9	O00512	1426 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	MS4A1	P11836	297 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	BTAF1	O14981	1849 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	G2E3	Q7L622	706 aa		15.48	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		15.48	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	HOXB7	P09629	217 aa		15.47	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		15.47	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	ATG3	Q9NT62	314 aa		15.47	■□□□□ 0.07

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