RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456462.5

NFS1-209, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5

Gene NFS1, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-209ENST00000456462 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.71■■□□□ 1.87
NFS1-209ENST00000456462 SSFA2P28290 1259 aa26.7■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.7■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.68■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 PHF14O94880 888 aa26.67■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.67■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 MSL1Q68DK7 614 aa26.67■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 ITPK1Q13572 414 aa26.66■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 GNPATO15228 680 aa26.65■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 HMOX1P09601 288 aa26.65■■□□□ 1.86
NFS1-209ENST00000456462 GPR162Q16538 588 aa26.63■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.63■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 UTRNP46939 3433 aa26.62■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 CFAP53Q96M91 514 aa26.61■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.6■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.59■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.59■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 ADRA2BP18089 450 aa26.58■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.58■■□□□ 1.85
NFS1-209ENST00000456462 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.57■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.57■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.57■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.57■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.56■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 SMIM5Q71RC9 77 aa26.54■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 NUDCQ9Y266 331 aa26.54■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 LGR6Q9HBX8 967 aa26.53■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.53■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 RPS6KA4O75676 772 aa26.52■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.52■■□□□ 1.84
NFS1-209ENST00000456462 GRIN3BO60391 1043 aa26.51■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 RFC4P35249 363 aa26.51■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.5■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 MRC1P22897 1456 aa26.49■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.46■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 MMP10P09238 476 aa26.46■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 PPP2R1AP30153 589 aa26.46■■□□□ 1.83
NFS1-209ENST00000456462 TEFQ10587 303 aa26.44■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.44■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 CHD4Q14839 1912 aa26.43■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 SLC39A6Q13433 755 aa26.43■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.43■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 GYS1P13807 737 aa26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 PRKAR2BP31323 418 aa26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.42■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.822e-6■■■■□ 20.2
NFS1-209ENST00000456462 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.41■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.4■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.4■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 FCHSD2O94868 740 aa26.39■■□□□ 1.82
NFS1-209ENST00000456462 TJP1Q07157 1748 aa26.39■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 ZPR1O75312 459 aa26.37■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 IL17REQ8NFR9 667 aa26.37■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.37■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 STARD3NLO95772 234 aa26.36■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 TGFB2P61812 414 aa26.36■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.36■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 NEFMP07197 916 aa26.34■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 ZNF790Q6PG37 636 aa26.34■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NFS1-209ENST00000456462 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.33■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 C4AP0C0L4 1744 aa26.32■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.31■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 FKBP8Q14318 412 aa26.3■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.3■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.3■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 COL15A1P39059 1388 aa26.3■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 BTBD11A6QL63 1104 aa26.29■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
NFS1-209ENST00000456462 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms