RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 MMP10P09238 476 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 CEP350Q5VT06 3117 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 DCAF5Q96JK2 942 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-209ENST00000451506 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 PANK3Q9H999 370 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 ADRA2BP18089 450 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 TGFB2P61812 414 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 RPS6KA4O75676 772 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 GYS1P13807 737 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 HSPA6P17066 643 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 CABP4P57796 275 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRN-209ENST00000451506 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 A0A0G2JLW4 131 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 KIF3CO14782 793 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 C4AP0C0L4 1744 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 RFC4P35249 363 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 MTHFSP49914 203 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 BCS1LQ9Y276 419 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 DPEP1P16444 411 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 MORC1Q86VD1 984 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN-209ENST00000451506 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 IFFO2Q5TF58 517 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 KCNA3P22001 575 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 IL13P35225 146 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 TJP1Q07157 1748 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 FCHSD2O94868 740 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 FKBP8Q14318 412 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 DDR1Q08345 913 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN-209ENST00000451506 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 TOMM70O94826 608 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 PIM2Q9P1W9 311 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 TM4SF1P30408 202 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 LGR6Q9HBX8 967 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 MRC1P22897 1456 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 APLP1P51693 650 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-209ENST00000451506 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 CHRNA5P30532 468 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 SLC39A6Q13433 755 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 ZPR1O75312 459 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 HMOX1P09601 288 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRN-209ENST00000451506 NARFQ9UHQ1 456 aa23.21■■□□□ 1.31
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