RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARXQ96QS3 562 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MSL1Q68DK7 614 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYT17Q9BSW7 474 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRC1P22897 1456 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MSH5O43196 834 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP6V1AP38606 617 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CABP4P57796 275 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AK7Q96M32 723 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP3K5Q99683 1374 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C4AP0C0L4 1744 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PHF14O94880 888 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LGR6Q9HBX8 967 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.52■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP2R1AP30153 589 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POLD1P28340 1107 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNPATO15228 680 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KLHL34Q8N239 644 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHD4Q14839 1912 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSFA2P28290 1259 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UTRNP46939 3433 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC39A6Q13433 755 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CFAP53Q96M91 514 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRKAR2BP31323 418 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.41■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IL17REQ8NFR9 667 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 YY1P25490 414 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPS6KA4O75676 772 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NUDCQ9Y266 331 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GYS1P13807 737 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPR162Q16538 588 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MMP10P09238 476 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADRA2BP18089 450 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNQ3O43525 872 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FCHSD2O94868 740 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RFC4P35249 363 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TEFQ10587 303 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MCM10Q7L590 875 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCTN1Q14203 1278 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FKBP8Q14318 412 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF790Q6PG37 636 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms