RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1AP38606 617 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 ITPK1Q13572 414 aa16.02■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.02■□□□□ 0.15
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PRAME-210ENST00000442481 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.87■□□□□ 0.13
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PRAME-210ENST00000442481 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.86■□□□□ 0.13
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PRAME-210ENST00000442481 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 FSTL1Q12841 308 aa15.84■□□□□ 0.13
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PRAME-210ENST00000442481 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 ZPR1O75312 459 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 DDR1Q08345 913 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 MORC1Q86VD1 984 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 KLRG1Q96E93 195 aa15.82■□□□□ 0.12
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PRAME-210ENST00000442481 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 TJP1Q07157 1748 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 CHRNA5P30532 468 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 JMYQ8N9B5 988 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 RNF181Q9P0P0 153 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 RRAGCQ9HB90 399 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.77■□□□□ 0.12
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