RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 KIAA0232Q92628 1395 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 ERC2O15083 957 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 KIF3BO15066 747 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 TCHHQ07283 1943 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 KDM4AO75164 1064 aa9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 SDSP20132 328 aa9.52□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 GNAI1P63096 354 aa9.52□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 TMX3Q96JJ7 454 aa9.52□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.52□□□□□ -0.88
LMO3-208ENST00000441439 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 MX1P20591 662 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CACNA1FO60840 1977 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 TMEM51Q9NW97 253 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 NFE2L2Q16236 605 aa9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 ADCY5O95622 1261 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 AOX1Q06278 1338 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 ARHGEF10O15013 1369 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CBX1P83916 185 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 SMTNL1A8MU46 457 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 UBE2HP62256 183 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 KCND1Q9NSA2 647 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 NCAPD2Q15021 1401 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 PTPRCP08575 1304 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CEP85Q6P2H3 762 aa9.49□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 FYB1O15117 783 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 SLFN14P0C7P3 912 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 USP48Q86UV5 1035 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.48□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 MCCP23508 829 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 KIF1AQ12756 1690 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 TULP2O00295 520 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 RNF214Q8ND24 703 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 STAP2Q9UGK3 403 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.47□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.46□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 ALS2Q96Q42 1657 aa9.46□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.46□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 MBIPQ9NS73 344 aa9.46□□□□□ -0.89
LMO3-208ENST00000441439 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.46□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 CCDC66A2RUB6 948 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 CDC25BP30305 580 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 USP31Q70CQ4 1352 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 TSPYL6Q8N831 410 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-208ENST00000441439 PTPRUQ92729 1446 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms