RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 KDRP35968 1356 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 GNPATO15228 680 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 ITPK1Q13572 414 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-206ENST00000431413 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 GRIN3BO60391 1043 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 HMOX1P09601 288 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 ADRA2BP18089 450 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 SMIM5Q71RC9 77 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-206ENST00000431413 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 CHD4Q14839 1912 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 RPS6KA4O75676 772 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 UTRNP46939 3433 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 RFC4P35249 363 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 MMP10P09238 476 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 CFAP53Q96M91 514 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 LGR6Q9HBX8 967 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-206ENST00000431413 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 GYS1P13807 737 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.36■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 NUDCQ9Y266 331 aa20.35■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 TGFB2P61812 414 aa20.34■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 MRC1P22897 1456 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 SLC39A6Q13433 755 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HERC3-206ENST00000431413 TEFQ10587 303 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 ZPR1O75312 459 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 STARD3NLO95772 234 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 PPP2R1AP30153 589 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 PRKAR2BP31323 418 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 TJP1Q07157 1748 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 C1QTNF8P60827 252 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 FKBP8Q14318 412 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 IL17REQ8NFR9 667 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-206ENST00000431413 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 A0A0G2JLW4 131 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 C4AP0C0L4 1744 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 ZNF790Q6PG37 636 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 BCS1LQ9Y276 419 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 FCHSD2O94868 740 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 NARFQ9UHQ1 456 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 ATP10DQ9P241 1426 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-206ENST00000431413 COL15A1P39059 1388 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms