RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 ATG3Q9NT62 314 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN4-202ENST00000415164 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.55■■□□□ 1.84
UBXN4-202ENST00000415164 PANK3Q9H999 370 aa26.54■■□□□ 1.84
UBXN4-202ENST00000415164 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
UBXN4-202ENST00000415164 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
UBXN4-202ENST00000415164 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 MMP10P09238 476 aa26.5■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.49■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.49■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 CABP4P57796 275 aa26.48■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 MORC1Q86VD1 984 aa26.48■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF5Q96JK2 942 aa26.48■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.47■■□□□ 1.83
UBXN4-202ENST00000415164 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.44■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 KDRP35968 1356 aa26.44■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 MTHFSP49914 203 aa26.43■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.43■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 RFC4P35249 363 aa26.42■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 BCS1LQ9Y276 419 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 ADCY9O60503 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 A0A0G2JLW4 131 aa26.39■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.39■■□□□ 1.82
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.38■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.38■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.38■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 RPS6KA4O75676 772 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 ADRA2BP18089 450 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 GYS1P13807 737 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 TGFB2P61812 414 aa26.35■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.34■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 FCHSD2O94868 740 aa26.33■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 DPEP1P16444 411 aa26.33■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 CEP350Q5VT06 3117 aa26.33■■□□□ 1.81
UBXN4-202ENST00000415164 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 HSPA6P17066 643 aa26.3■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 IL13P35225 146 aa26.3■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 C4AP0C0L4 1744 aa26.28■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 HMOX1P09601 288 aa26.27■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.27■■□□□ 1.8
UBXN4-202ENST00000415164 KIF3CO14782 793 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 FKBP8Q14318 412 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 LGR6Q9HBX8 967 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.23■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 ZPR1O75312 459 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 DDR1Q08345 913 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 SLC39A6Q13433 755 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 PIM2Q9P1W9 311 aa26.22■■□□□ 1.79
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UBXN4-202ENST00000415164 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-202ENST00000415164 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.2■■□□□ 1.79
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UBXN4-202ENST00000415164 TJP1Q07157 1748 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 KCNA3P22001 575 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 CHRNA5P30532 468 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.18■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.16■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 TOMM70O94826 608 aa26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 RNF181Q9P0P0 153 aa26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-202ENST00000415164 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 COL15A1P39059 1388 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 IFFO2Q5TF58 517 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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