RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 STK31Q9BXU1 1019 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 BTBD11A6QL63 1104 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNQ3O43525 872 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 NECTIN2Q92692 538 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 SPG7Q9UQ90 795 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 PHKG2P15735 406 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 SMC5Q8IY18 1101 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 F6X3S4 739 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 FLIIQ13045 1269 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 HOXB7P09629 217 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM161AQ3B820 660 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 C8orf34Q49A92 452 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5-204ENST00000412806 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP27B1O15528 508 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MRC1P22897 1456 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 C5P01031 1676 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MEIS3Q99687 375 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP10DQ9P241 1426 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 STRN4Q9NRL3 753 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP5-204ENST00000412806 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.14■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.14■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 DCAF5Q96JK2 942 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 NUCB1Q02818 461 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 EVA1CP58658 441 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 GCC1Q96CN9 775 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 PHLPP1O60346 1717 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC39A6Q13433 755 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF790Q6PG37 636 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 MSH5O43196 834 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 IL2RBP14784 551 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP85Q6P2H3 762 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 ANXA1P04083 346 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5-204ENST00000412806 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 LNPKQ9C0E8 428 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 BTG4Q9NY30 223 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 CABP4P57796 275 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 PROSER3Q2NL68 480 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 DCTPP1Q9H773 170 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP5-204ENST00000412806 GLI3P10071 1580 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 ADCY9O60503 1353 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 LAMB4A4D0S4 1761 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 GNAI2P04899 355 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 USP35Q9P2H5 1018 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 UBR2Q8IWV8 1755 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 GNAI3P08754 354 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 PAPPAQ13219 1627 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 USP44Q9H0E7 712 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 PDIA6Q15084 440 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5-204ENST00000412806 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms