RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLCB2Q00722 1185 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PHKA2P46019 1235 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DGKGP49619 791 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CTBSQ01459 385 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PGBD3Q8N328 593 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNMA1Q8ND90 353 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRIM66O15016 1216 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FGFR3P22607 806 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CLN3Q13286 438 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF135Q8IUD6 432 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EFHC2Q5JST6 749 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHSY3Q70JA7 882 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLVAPQ9BX97 442 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RUBCNLQ9H714 662 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A1B0GTH6 734 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DYRK3O43781 588 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BNIP3LO60238 219 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARAFP10398 606 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ERVK-9P63128 1117 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1135P-201ENST00000411083 APBA3O96018 575 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CENPCQ03188 943 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRIM11Q96F44 468 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 AK7Q96M32 723 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COBLO75128 1261 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 AP1G2O75843 785 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MSX1P28360 303 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF20Q5VTR2 975 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC125Q86Z20 511 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CNKSR1Q969H4 720 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPDYE3A6NKU9 549 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LRP8Q14114 963 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRRT3Q5FWE3 981 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GNASQ5JWF2 1037 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NDFIP2Q9NV92 336 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ADH6P28332 368 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SCTRP47872 440 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GNRH1P01148 92 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDE4DQ08499 809 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C4orf17Q53FE4 359 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OSBPL3Q9H4L5 887 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KLF15Q9UIH9 416 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRAK2O60296 914 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IL2RAP01589 272 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NACC1Q96RE7 527 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZBBXA8MT70 800 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM229AH3BQW9 127 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PAX4O43316 350 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ALAS2P22557 587 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TXKP42681 527 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CD33P20138 364 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GRIK4Q16099 956 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MCTP1Q6DN14 999 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 XAGE2Q96GT9 111 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms