RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398179.3

CCBE1-201, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CCBE1, Length 5,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-201ENST00000398179 HIP1RO75146 1068 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 CCDC80Q76M96 950 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 ATG3Q9NT62 314 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 PNMA2Q9UL42 364 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TACC1O75410 805 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 GOLGA3Q08378 1498 aa14.89□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MCM3P25205 808 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 CCDC102AQ96A19 550 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MSL3P1P0C860 447 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 BECN2A8MW95 431 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 FAM161AQ3B820 660 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 KCNH8Q96L42 1107 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 POLE3Q9NRF9 147 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TRAK2O60296 914 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 KIF5AQ12840 1032 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TMTC2Q8N394 836 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 SMARCE1Q969G3 411 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 IQCA1Q86XH1 822 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TSPY26PQ9H489 355 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 SPC24Q8NBT2 197 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 POTEB2H3BUK9 544 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 KRT7P08729 469 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 CCDC6Q16204 474 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TMX1Q9H3N1 280 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 CCDC63Q8NA47 563 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 ST18O60284 1047 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MSL1Q68DK7 614 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 VCAM1P19320 739 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 MORC1Q86VD1 984 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TMED1Q13445 227 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TRIM11Q96F44 468 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 FLOT2Q14254 428 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 PLCB4Q15147 1175 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 BICD2Q8TD16 824 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 VCX3BQ9H321 246 aa14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
CCBE1-201ENST00000398179 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SERPINI2O75830 405 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SEMA3FQ13275 785 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 ZNF428Q96B54 188 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 ABCF2Q9UG63 623 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 NEDD9Q14511 834 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 BIRC3Q13489 604 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 BHMTQ93088 406 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 UBXN4Q92575 508 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 BICD1Q96G01 975 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 POGKQ9P215 609 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SKILP12757 684 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 MCTP2Q6DN12 878 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-201ENST00000398179 SMC6Q96SB8 1091 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms