RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB3Q9H5J0 574 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TREHO43280 583 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 SGSM3Q96HU1 749 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 UNC13BO14795 1591 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 RREB1Q92766 1687 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 FGRP09769 529 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TMC4Q7Z404 712 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 POTECB2RU33 542 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 GCGRP47871 477 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 FOSBP53539 338 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TYW1BQ6NUM6 668 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NME8Q8N427 588 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 BOLA1Q9Y3E2 137 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 RCCD1A6NED2 376 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 C21orf2O43822 256 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 HSD3B2P26439 372 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PTPROQ16827 1216 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 SLF2Q8IX21 1173 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 SMC5Q8IY18 1101 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MKL1Q969V6 931 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 RNF19AQ9NV58 838 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 LRP6O75581 1613 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 F12P00748 615 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ATP2B4P23634 1241 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 POTEEQ6S8J3 1075 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PHF12Q96QT6 1004 aa3.56□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ANK2Q01484 3957 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB5A4FU69 1503 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PPFIA4O75335 1185 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 WEE1P30291 646 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NR1H3Q13133 447 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DESI1Q6ICB0 168 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MCF2L2Q86YR7 1114 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MS4A3Q96HJ5 214 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L5A8MUK1 530 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 FAM129BQ96TA1 746 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MAF1Q9H063 256 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PCDH10Q9P2E7 1040 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PRXQ9BXM0 1461 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CTSHP09668 335 aa3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 GCC2Q8IWJ2 1684 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 GAPVD1Q14C86 1478 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CD44P16070 742 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NEO1Q92859 1461 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO45P0C2W1 286 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 POTEAQ6S8J7 498 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 USP46P62068 366 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CBLBQ13191 982 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NR6A1Q15406 480 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TMC7Q7Z402 723 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.54□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CLSTN1O94985 981 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 APLP1P51693 650 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 AMPD3Q01432 767 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 VTI1AQ96AJ9 217 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 BCL11AQ9H165 835 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ZRANB1Q9UGI0 708 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TSKSQ9UJT2 592 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF5Q12774 1597 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 GJA8P48165 433 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PMM1Q92871 262 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.842e-7■■■■□ 22.2
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1024Q9UPX6 916 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MED14O60244 1454 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms