RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362524.1

RNU6-600P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 600, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-600P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-600P-201ENST00000362524 SH3BP5O60239 455 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PPFIA4O75335 1185 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 DNAJB2P25686 324 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ATP2B2Q01814 1243 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PDE3BQ13370 1112 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 NCOA4Q13772 614 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 OCLNQ16625 522 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 EML3Q32P44 896 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 SLFNL1Q499Z3 407 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 SIX5Q8N196 739 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 TSC1Q92574 1164 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 CYLDQ9NQC7 956 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PARP2Q9UGN5 583 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 FAM13AO94988 1023 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 SEC13P55735 322 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PSMD2Q13200 908 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 BIRC2Q13490 618 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 NR6A1Q15406 480 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ECM1Q16610 540 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 TMC7Q7Z402 723 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 TMTC2Q8N394 836 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 NME8Q8N427 588 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 OGFOD1Q8N543 542 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 GPATCH11Q8N954 259 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 TATDN2Q93075 761 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 COL26A1Q96A83 441 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 MAF1Q9H063 256 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 TSKSQ9UJT2 592 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 TK2O00142 265 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 PRMT3O60678 531 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 FBXO45P0C2W1 286 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 NPR3P17342 541 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 RDH13Q8NBN7 331 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 SGSM3Q96HU1 749 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 C8orf48Q96LL4 319 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-600P-201ENST00000362524 POTEB3A0JP26 581 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 CFAP99D6REC4 459 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 PDGFRBP09619 1106 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 FGRP09769 529 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 RHBDL3P58872 404 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 ARSHQ5FYA8 562 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 POTEBQ6S5H4 581 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 HELQQ8TDG4 1101 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 CRELD1Q96HD1 420 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 LRCH3Q96II8 777 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 SCYL1Q96KG9 808 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 CEP89Q96ST8 783 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 EYA1Q99502 592 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 NOD1Q9Y239 953 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 SCNN1AP37088 669 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 GCGRP47871 477 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 TNNI2P48788 182 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 DESI1Q6ICB0 168 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 JDP2Q8WYK2 163 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-600P-201ENST00000362524 JADE2Q9NQC1 790 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms