RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 IL2RBP14784 551 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF428Q96B54 188 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN4-201ENST00000340958 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN4-201ENST00000340958 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN4-201ENST00000340958 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.27■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 TSPYL6Q8N831 410 aa22.27■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.27■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 LRRC37A3O60309 1634 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.25■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 VAMP4O75379 141 aa22.25■■□□□ 1.15
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CLDN4-201ENST00000340958 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.153e-14■■■■■ 90.9
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CLDN4-201ENST00000340958 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 CRBNQ96SW2 442 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 DISP2A7MBM2 1401 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 BTBD11A6QL63 1104 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 FAM182BQ5T319 152 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN4-201ENST00000340958 KRT24Q2M2I5 525 aa22.21■■□□□ 1.15
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CLDN4-201ENST00000340958 KIF16BQ96L93 1317 aa22.2■■□□□ 1.14
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CLDN4-201ENST00000340958 PDE3AQ14432 1141 aa22.2■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 DCAF5Q96JK2 942 aa22.2■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 CYP27B1O15528 508 aa22.19■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 MS4A1P11836 297 aa22.19■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 DDB1Q16531 1140 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 PANK1Q8TE04 598 aa22.16■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLDN4-201ENST00000340958 CABP4P57796 275 aa22.14■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.14■■□□□ 1.13
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CLDN4-201ENST00000340958 TNS2Q63HR2 1409 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 COG6Q9Y2V7 657 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 STK31Q9BXU1 1019 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 EXOC5O00471 708 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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CLDN4-201ENST00000340958 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.11■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 KCNQ3O43525 872 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 TNNQ9UQP3 1299 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLDN4-201ENST00000340958 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLDN4-201ENST00000340958 NECTIN2Q92692 538 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN4-201ENST00000340958 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLDN4-201ENST00000340958 CCDC125Q86Z20 511 aa22.08■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.08■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 SLC39A6Q13433 755 aa22.07■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF790Q6PG37 636 aa22.07■■□□□ 1.12
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CLDN4-201ENST00000340958 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.06■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.06■■□□□ 1.12
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CLDN4-201ENST00000340958 TRIM37O94972 964 aa22.05■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.05■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 PTPRCP08575 1304 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 MRC1P22897 1456 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN4-201ENST00000340958 BCL9O00512 1426 aa22.02■■□□□ 1.11
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