RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 UVSSAQ2YD98 709 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 POTEJP0CG39 1038 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 KIF20AO95235 890 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 VPS36Q86VN1 386 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 BTBD11A6QL63 1104 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 AIDAQ96BJ3 306 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 CENPHQ9H3R5 247 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 DDX11Q96FC9 970 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 RAB34Q9BZG1 259 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 ANKRD62A6NC57 917 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 TSG101Q99816 390 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 WDR97A6NE52 1622 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PTPRCP08575 1304 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PAF1Q8N7H5 531 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 CASQ1P31415 396 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PAFAH1B1P43034 410 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 FBXO3Q9UK99 471 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 NSD2O96028 1365 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 C8orf76Q96K31 380 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 FAM177BA6PVY3 158 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 NAIPQ13075 1403 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 ATP2B2Q01814 1243 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 RAI14Q9P0K7 980 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 FAM193AP78312 1265 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 MYL6BP14649 208 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 MPNDQ8N594 471 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 YEATS4O95619 227 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2N-201ENST00000318066 STARD3NLO95772 234 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TUBB4AP04350 444 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TNNT1P13805 278 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC184Q52MB2 194 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 KANK3Q6NY19 840 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 STX1AQ16623 288 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 IL16Q14005 1332 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 DYNC1I1O14576 645 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF76P36508 570 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 FERMT3Q86UX7 667 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TNIP1Q15025 636 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 IFT140Q96RY7 1462 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 MYZAPP0CAP1 466 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 EVI5LQ96CN4 794 aa22.05■■□□□ 1.12
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