RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 BTBD11A6QL63 1104 aa26.7■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 VAMP4O75379 141 aa26.69■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 DDB1Q16531 1140 aa26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT24Q2M2I5 525 aa26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO41Q8TF61 875 aa26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.67■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 CABP4P57796 275 aa26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 PLIN1O60240 522 aa26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.65■■□□□ 1.86
PACSIN3-201ENST00000298838 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 ATRNO75882 1429 aa26.63■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 GLI3P10071 1580 aa26.62■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF16BQ96L93 1317 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNQ3O43525 872 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF790Q6PG37 636 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-201ENST00000298838 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.58■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXB7P09629 217 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB4P16144 1822 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 PAPPAQ13219 1627 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0G2JS52 829 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 MYT1Q01538 1121 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC39A6Q13433 755 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE3AQ14432 1141 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNA1FO60840 1977 aa26.52■■□□□ 1.84
PACSIN3-201ENST00000298838 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.51■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 STK31Q9BXU1 1019 aa26.51■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.5■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.5■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 MS4A1P11836 297 aa26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL9O00512 1426 aa26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 C5P01031 1676 aa26.48■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM27P14373 513 aa26.48■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGBQ92521 554 aa26.48■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.48■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A2P04920 1241 aa26.47■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.47■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 NECTIN2Q92692 538 aa26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 CRBNQ96SW2 442 aa26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 PANK1Q8TE04 598 aa26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNQ9UQP3 1299 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRCP08575 1304 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 RLBP1P12271 317 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 ATG3Q9NT62 314 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 COG6Q9Y2V7 657 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
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