RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 GCC1Q96CN9 775 aa27.08■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.07■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 HOXB7P09629 217 aa27.06■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 NUCB1Q02818 461 aa27.06■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.06■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.06■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 G2E3Q7L622 706 aa27.06■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 MEGF6O75095 1541 aa27.05■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.04■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.04■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.04■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 SPG7Q9UQ90 795 aa27.04■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 BTBD11A6QL63 1104 aa27.03■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.02■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP10DQ9P241 1426 aa27.02■■□□□ 1.92
SNRNP25-201ENST00000293861 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.01■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 FLIIQ13045 1269 aa27.01■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR17Q8IZU2 1322 aa27■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 CHD1LQ86WJ1 897 aa27■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.99■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 PHKG2P15735 406 aa26.98■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.98■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.97■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.97■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.97■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.97■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.96■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.96■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
SNRNP25-201ENST00000293861 MEIS3Q99687 375 aa26.95■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 F6X3S4 739 aa26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 DCTPP1Q9H773 170 aa26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNQ3O43525 872 aa26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP85Q6P2H3 762 aa26.94■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 MRC1P22897 1456 aa26.93■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 NECTIN2Q92692 538 aa26.93■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 LNPKQ9C0E8 428 aa26.93■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.92■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.92■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.92■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.91■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF5Q96JK2 942 aa26.91■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.9■■□□□ 1.9
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP27B1O15528 508 aa26.89■■□□□ 1.9
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SNRNP25-201ENST00000293861 SEC24BO95487 1268 aa26.88■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 GNAI3P08754 354 aa26.87■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.86■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 GNAI2P04899 355 aa26.85■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.84■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.84■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 HMMRO75330 724 aa26.84■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF790Q6PG37 636 aa26.84■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.84■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 C5P01031 1676 aa26.83■■□□□ 1.89
SNRNP25-201ENST00000293861 IL2RBP14784 551 aa26.82■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 EVA1CP58658 441 aa26.82■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.82■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 STRN4Q9NRL3 753 aa26.8■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 USP44Q9H0E7 712 aa26.78■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.78■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.78■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.77■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC39A6Q13433 755 aa26.77■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.77■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 HYPKQ9NX55 129 aa26.77■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 CABP4P57796 275 aa26.77■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNRNP25-201ENST00000293861 ADCY9O60503 1353 aa26.76■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP8B2P98198 1209 aa26.76■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.76■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.75■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 BEND3Q5T5X7 828 aa26.75■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.75■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.75■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.74■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.74■■□□□ 1.87
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