RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CPA1P15085 419 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 GNAI1P63096 354 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 BICD2Q8TD16 824 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ERVK-7P63135 1459 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 MBIPQ9NS73 344 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 NOS1P29475 1434 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 SYT1P21579 422 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 TEX35Q5T0J7 233 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 FAM83GA6ND36 823 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 PDE1AP54750 535 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 TYRO3Q06418 890 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 IL16Q14005 1332 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 BECN2A8MW95 431 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CD109Q6YHK3 1445 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 EVC2Q86UK5 1308 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 RAPGEF3O95398 923 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 F13A1P00488 732 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN2P17655 700 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 RSPH14Q9UHP6 348 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 FANCAO15360 1455 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 ARID5BQ14865 1188 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CEP85Q6P2H3 762 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 HOMER1Q86YM7 354 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CUL4AQ13619 759 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 PTPRTO14522 1441 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 CBX8Q9HC52 389 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRR-201ENST00000283228 F6X3S4 739 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 SKILP12757 684 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF165P49910 485 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 TOMM22Q9NS69 142 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 DACT1Q9NYF0 836 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 USP27XA6NNY8 438 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 GJB2P29033 226 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 NECTIN2Q92692 538 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 FOSBP53539 338 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 NECAB1Q8N987 351 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 LIG1P18858 919 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 SHROOM2Q13796 1616 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRL1O94910 1474 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF75DP51815 510 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF428Q96B54 188 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 CASTP20810 708 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 AK2P54819 239 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 KRT85P78386 507 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 NFE2L2Q16236 605 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 USP16Q9Y5T5 823 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ABCC4O15439 1325 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 MNS1Q8NEH6 495 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 CHMLP26374 656 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 SPG7Q9UQ90 795 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ASXL2Q76L83 1435 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 ABCC1P33527 1531 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 GPS2Q13227 327 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 TMCO3Q6UWJ1 677 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 OSCARQ8IYS5 282 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms