RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 VPS72Q15906 364 aa22.95■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 BTBD11A6QL63 1104 aa22.94■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.93■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.93■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 AFF2P51816 1311 aa22.92■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.92■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.92■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 BARGINQ6ZT62 677 aa22.91■■□□□ 1.26
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IMP4-201ENST00000259239 KCNQ3O43525 872 aa22.9■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.9■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.9■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 GLI3P10071 1580 aa22.89■■□□□ 1.26
IMP4-201ENST00000259239 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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IMP4-201ENST00000259239 DDB1Q16531 1140 aa22.88■■□□□ 1.25
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IMP4-201ENST00000259239 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.85■■□□□ 1.25
IMP4-201ENST00000259239 C5P01031 1676 aa22.85■■□□□ 1.25
IMP4-201ENST00000259239 SLC39A6Q13433 755 aa22.85■■□□□ 1.25
IMP4-201ENST00000259239 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.85■■□□□ 1.25
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IMP4-201ENST00000259239 ZNF790Q6PG37 636 aa22.83■■□□□ 1.25
IMP4-201ENST00000259239 KIF16BQ96L93 1317 aa22.83■■□□□ 1.25
IMP4-201ENST00000259239 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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IMP4-201ENST00000259239 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.81■■□□□ 1.24
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IMP4-201ENST00000259239 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
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IMP4-201ENST00000259239 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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IMP4-201ENST00000259239 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-201ENST00000259239 RGS12O14924 1447 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 PTPRCP08575 1304 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 SBF2Q86WG5 1849 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-201ENST00000259239 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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