RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000244906.6

DKFZP434K028-201, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DKFZP434K028, Length 927 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GNPATO15228 680 aa20.31■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.31■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HSPA6P17066 643 aa20.29■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.29■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KIF3CO14782 793 aa20.27■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MMP10P09238 476 aa20.27■□□□□ 0.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.26■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.24■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KDRP35968 1356 aa20.24■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 A0A0G2JLW4 131 aa20.24■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.24■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C4AP0C0L4 1744 aa20.22■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.21■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TGFB2P61812 414 aa20.21■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.21■□□□□ 0.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.2■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BCS1LQ9Y276 419 aa20.2■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.2■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GYS1P13807 737 aa20.19■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DPEP1P16444 411 aa20.19■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RPS6KA4O75676 772 aa20.18■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.18■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DCAF5Q96JK2 942 aa20.18■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.18■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KCNA3P22001 575 aa20.17■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SBF1O95248 1867 aa20.16■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.16■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADRA2BP18089 450 aa20.15■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RFC4P35249 363 aa20.15■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CABP4P57796 275 aa20.15■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TJP1Q07157 1748 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FCHSD2O94868 740 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.14■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.13■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PANK3Q9H999 370 aa20.13■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TOMM70O94826 608 aa20.12■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MTHFSP49914 203 aa20.12■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.12■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.12■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.12■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.11■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 APLP1P51693 650 aa20.1■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FKBP8Q14318 412 aa20.1■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DDR1Q08345 913 aa20.09■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.09■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.08■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PIM2Q9P1W9 311 aa20.08■□□□□ 0.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 WDR90Q96KV7 1748 aa20.07■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.07■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TM4SF1P30408 202 aa20.06■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CHRNA5P30532 468 aa20.06■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.06■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MORC1Q86VD1 984 aa20.05■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IL13P35225 146 aa20.04■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HTRA3P83110 453 aa20.03■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.03■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LGR6Q9HBX8 967 aa20.03■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.02■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.01■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RRAGCQ9HB90 399 aa20.01■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RNF181Q9P0P0 153 aa20.01■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.99■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SLC39A6Q13433 755 aa19.99■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.99■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.99■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.98■□□□□ 0.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms