RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000014640.8

Ankrd28-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd28, Length 6,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 InsrP15208 1372 aa27.43■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Irf9Q61179 399 aa27.43■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa27.43■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Naip2Q9QUK4 1447 aa27.43■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Prkar2bP31324 416 aa27.42■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Farp2Q91VS8 1065 aa27.42■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abcc5Q9R1X5 1436 aa27.42■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ssh1Q76I79 1042 aa27.42■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gjb2Q00977 226 aa27.41■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa27.41■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gimap5Q8BWF2 308 aa27.41■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Spg7Q3ULF4 781 aa27.39■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Frmd3Q8BHD4 595 aa27.39■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Soga3Q6NZL0 945 aa27.39■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tmem67Q8BR76 992 aa27.39■■□□□ 1.98
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Exoc5Q3TPX4 708 aa27.39■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ifit1bl2Q3U687 466 aa27.39■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slf2Q6P9P0 1278 aa27.39■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Idi2Q8BFZ6 227 aa27.39■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gas2l3Q3UWW6 683 aa27.38■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 GptQ8QZR5 496 aa27.38■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Trim30cD3YVI9 513 aa27.38■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slc12a5Q91V14 1138 aa27.38■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 IncenpQ9WU62 880 aa27.37■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Myd88P22366 296 aa27.37■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pde4dQ01063 747 aa27.37■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Map3k2Q61083 619 aa27.37■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plagl1Q9JLQ4 704 aa27.37■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 CastP51125 788 aa27.37■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa27.36■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TxlnbQ8VBT1 685 aa27.36■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cul5Q9D5V5 780 aa27.36■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NsmfQ99NF2 532 aa27.36■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TimelessQ9R1X4 1197 aa27.36■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fez1Q8K0X8 392 aa27.35■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tsg101Q61187 391 aa27.35■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NinlQ6ZQ12 1394 aa27.35■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mcm10Q0VBD2 885 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cyp7a1Q64505 503 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Olr1Q9EQ09 363 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 AI481877A2ALV5 1481 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Syce3B5KM66 88 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Aplp1Q03157 653 aa27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cdan1Q8CC12 1239 aa27.33■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Znf131Q8K3J5 619 aa27.33■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Znf18Q810A1 556 aa27.33■■□□□ 1.97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Znf697Q569E7 569 aa27.33■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Grin2aP35436 1464 aa27.32■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Bcar3Q9QZK2 820 aa27.32■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Trim11Q99PQ2 467 aa27.32■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Traf3ip1Q149C2 625 aa27.32■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa27.32■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Chpf2Q3UU43 768 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc181Q80ZU5 509 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppm1eQ80TL0 749 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gnat3Q3V3I2 354 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Wwc1Q5SXA9 1104 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sh3d21Q7TSG5 549 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rnf41Q8BH75 317 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pik3r4Q8VD65 1358 aa27.31■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rad23bP54728 416 aa27.3■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tmem87bQ8BKU8 555 aa27.3■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slc14a2Q8R4T9 930 aa27.3■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp10dQ8K2X1 1416 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cwc25Q9DBF7 416 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Brms1Q99N20 246 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Polr3aB2RXC6 1390 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Q9D5Q8 446 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Map9Q3TRR0 646 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa27.29■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Txndc16Q7TN22 820 aa27.28■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa27.28■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cct2P80314 535 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Def6Q8C2K1 630 aa27.28■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Wdr62Q3U3T8 1523 aa27.28■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ces1aE9PYP1 563 aa27.27■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa27.27■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gbp4Q61107 620 aa27.27■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fam135aQ6NS59 1506 aa27.27■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa27.27■■□□□ 1.96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa27.26■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa27.26■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Smarcc1P97496 1104 aa27.26■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Top2bQ64511 1612 aa27.26■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tacc1Q6Y685 774 aa27.25■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Dzip1Q8BMD2 852 aa27.25■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Jakmip2D3YXK0 820 aa27.25■■□□□ 1.95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fbf1A2A870 1173 aa27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 6.1 ms