Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms