Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms