Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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