Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP4Q9UKK3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms