Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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