Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP68Q9UHB9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms