Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL13Q9P2N7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms