Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC180Q9P1Z9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms