Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms