Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RLIMQ9NVW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms