Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms