Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms