Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTIF3Q9H2K0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms