Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VN1R3Q9BXE9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms