Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms